深化医改工作实施三年多以来，山东各地积极推进五项重点改革，改革成果明显。下一步，全省医改将突出县级公立医院综合改革和新农合大病医疗保险两大重点，向新阶段迈进。
从2009到2011年，山东省各级财政投入医改资金796亿元，年均增长39.3%。全省城镇基本医保和新农合参保率分别达到97%和99.9%，基本药物制度实现基层全覆盖，结束了基层医疗卫生机构“
以药补医”的历史。
面临着新的形势和任务。今年，山东将加快推进公立医院改革进度，特别是抓好县级公立医院综合改革试点工作，以破除“以药补医”为突破口，取消县级医院的药品加成收入。其中先行试点的县级公立医院要在今年年底前全部取消药品加成政策，确保药品价格降低15%左右，并将药品销售价格向社会公示。医院在取消药品加成政策后减少的合理收入，将通过财政和适当上调医疗服务价格得到补偿。
加快县级公立医院改革的同时，山东还拓展和延伸新农合制度，开展新农合大病医疗保险工作，从明年开始，在新农合报销的基础上，对参合居民大病患者发生的高额医疗费用再给予补偿，目前已将包括儿童先天性心脏病、终末期肾病、乳腺癌、宫颈癌、重性精神疾病在内的二十类重大疾病纳入大病保险保障范围，原则上医疗费用越高补偿比例越高，参保患者个人最高年补偿将达到二十万元。