曲阜经济开发区成立以来，十分重视环境保护和生态建设，与曲阜市生态、宜居城市发展相协调，坚守环保低碳底线，践行循环经济生态文明理念，经过二十多年的持续发展，已经成为曲阜经济发展的重要增长极和高端高质高效产业的聚集区，为创建国家级千亿园区和省级生态工业园区打下了坚实的基础。
一是严格控制高消耗、高污染和低水平项目，坚决关停和拒绝了大批问题项目；同时鼓励占地少、无污染、能源消耗少、附加值高、科技含量高、投资规模大、产业带动性强、具有自主知识产权的项目入区发展，在建项目的水平和档次大大提高。
二是优化产业结构。曲阜经济开发区充分发挥环境与交通资源优势，弱化一般工业，着力发展汽配机械、物联网、新能源、医药四大产业，加快主导产业集群发展。目前已初步形成生物医药、机械加工、建筑产业、纺织服装产业、食品加工、商贸物流六大基础企业，集聚起一批生物医药、天然药材研制、中西药结合创新的医药企业，有力地提升和优化了开发区产业结构，为实现开发区快速、健康和可持续发展打下了雄厚的项目基础，实现社会经济和自然生态的双赢。
三是用循环经济的理念完善基础设施。建设了济宁海关曲阜口岸、华能保税库、热电厂集中供热，排污入网达标排放，鼓励中水回用。区内全面实现“七通一平”，局部实现供水、供气、供热、排水、排污、电力、通讯、宽带、道路等“九通一平”。路网清晰，河水清澈。绿化、美化、亮化、净化同步推进，修建三处公园及垃圾处理中转站，给入区企业创造了优美便利的工作生活环境。